車體險理賠發問

我的車停在紅線上被汽車轉彎撞倒，沒有人受傷，依照肇事責任的話是我3成對方7成，
假設修車總共花了5000，如果對方理賠3500，我自己負擔1500，
但後續發現保險公司從我的車體險額度扣了5000，
保險公司給的解釋是說，因為當初聯絡不到對方的保險公司，所以修車3500是由公司吸收，1500則是自行吸收，雖然修完車確實有拿到保險公司理賠的5000元，但是額度也被扣了5000，保險公司跟我說因為雖然扣了我的保險額度，但我實際上也沒有出到錢，如果要去跟對方保險公司討的話也站不住腳，我也擔心自己去跟對方保險公司討的話會觸法，那這樣是算我自己的損失嗎？等於對方保險公司沒有理賠的動作，那我可以自己去跟對方保險公司討嗎？
當初結案的時候只有收到簡訊通知，但完全不知道修車錢全額扣我的額度，也不知道對方沒有理賠。